Étude de l'organisation générale d'un anticorps avec le logiciel Rastop

 

   Utiliser le logiciel Rastop pour déterminer la structure d'un anticorps (forme, nombre de chaînes, liaisons entre les différentes chaînes) :

 

ØTélécharger la molécule d'anticorps (clic droit puis "enregistrer la cible sous", enregistrer la molécule sur votre bureau ou dans vos documents)

ØOuvrir la molécule avec le logiciel RASTOP (cf fiche technique).

ØAfficher la molécule en Boules et bâtonnets
Ø Identifier le nombre de chaînes en colorant la molécule par chaîne : Atomes, Colorer par, Chain
Ø Identifier les liaisons entre les différentes chaînes :

  - Cliquer sur Rubans Type Squelette carboné

  - Cliquer sur Faire afficher les ponts disulfure: liaison, pont disulfure

Pour mieux visualiser les ponts disulfure :liaison, pont disulfure, type, bâtonnets choisir un rayon de 250 puis colorer les ponts disulfure à l'aide de la palette de coloration.

ØCliquer sur chacune des chaînes et repérer, à chaque fois, la lettre qui la représente dans la fenêtre d’affichage (tout en bas de l'écran).