Qu'est-ce qu'un arbre phylogénétique ?

 Un arbre phylogénétique permet de représenter l'histoire évolutive d'un ensemble d'espèces ainsi que les parentés qui en découlent.

                 La construction d'un arbre phylogénétique est basée sur le partage de caractères dérivés. En effet un caractère dérivé correspond à une innovation évolutive : on considère alors que toutes les espèces qui partagent ce caractère dérivé l'ont hérité d'un ancêtre commun.

 

 

- Un arbre phylogénique est constitué de branches à l'extrémité desquelles sont placées les espèces actuelles et les espèces fossiles. A chaque noeud de l'arbre se trouve non pas un fossile  mais un ancêtre commun hypothétique.  Sur les branches des arbres, on note, par un petit trait perpendiculaire à la branche ou par un petit rond, la ou les innovations évolutives (= caractères dérivés acquis).

 

- Si on considère un ancêtre commun hypothétique et toutes les espèces vivantes et fossiles qui en dérivent, ils partagent un certain nombre de caractères dérivés (d'innovations évolutives) acquis avant l'apparition de l'ancêtre commun hypothétique.

 

- On ne connait pas l'ancêtre commun hypothétique mais on peut dresser son portrait robot : ce portrait robot est la liste de tous les caractères dérivés (de toutes les innovations évolutives) acquis avant cet ancêtre commun.

 

- Plus 2 espèces partagent de caractères dérivés, plus elles sont proches. Exemple : l'espèce B est plus apparentée à l'espèce E qu'à l'espèce A car elle partage plus de caractères dérivés avec l'espèce E qu'avec l'espèce A.

 

- On peut insérer une échelle de temps sur un tel arbre. Dans ce cas, on veillera à ce que toutes les branches de l'arbre conduisant aux espèces actuelles aient la même longueur. Les branches conduisant aux espèces fossiles seront plus courtes et se termineront au moment de l'extinction de l'espèce concernée.