Étude de l'organisation générale d'un anticorps avec le logiciel Libmol

 

Etude de la structure d'un anticorps (forme, nombre de chaînes, liaisons entre les différentes chaînes) avec le logiciel libmol :

 

- Ouvrir "Libmol" dans un nouvel onglet du navigateur. (ici la fiche technique)

- Télécharger la molécule d'anticorps (clic droit puis "enregistrer la cible sous", enregistrer la molécule sur votre bureau ou dans vos documents).

- Ouvrir la molécule avec le logiciel en utilisant "charger un fichier local".

- Dans l'onglet "commande" :

             - Afficher la molécule en Boules et bâtonnets.

             - Identifier le nombre de chaînes en colorant la molécule par chaînes.

- Identifier les liaisons entre les différentes chaînes: cliquer sur Squelette puis  sur l'icône en haut à droite, faire afficher  ponts disulfures.

- Dans l'onglet "séquence" : faire glisser le curseur sur le nom (lettre) des différentes chaînes  (séquence d'acides aminés)  pour les repérer dans la molécule d'anticorps.

 

Réalisation du compte rendu :

 

Dans l'onglet "commande", choisir le mode de représentation le plus adapté pour montrer la structure d'un anticorps.

Faire une capture d'écran en utilisant l'outil capture.

Légender votre capture d'écran de manière à montrer : - la forme de l'anticorps

                                                                                        - le nombre de chaîne et les liaison entre ces chaînes

                                                                                        - le nom des différentes chaînes.

Aide :

Photographie et schéma d'un anticorps