Utiliser la séquence de l'opsine bleue pour établir des relations de parenté

 

En utilisant :

- le logiciel Anagène

- sa fiche technique

- le fichier de séquences "opsine bleue" contenant les séquences protéiques de l'opsine bleue de quelques primates

ATTENTION : télécharger le fichier (clic droit sur lien /enregistrer la cible du lien sous) et l'enregistrer dans mes documents. Ouvrir Anagène PUIS ouvrir le fichier téléchargé depuis Anagène.

construire l'arbre de parenté des espèces de primates étudiées.

 

Pour y parvenir:

1. Construire un tableau à double entrée comprenant les espèces dont on cherche à établir les parentés :

Tableau de comparaison de séquences de l'opsine bleue de quelques primates

  Homme Chimpanzé Gorille Macaque Tarsier
Homme 100%        
Chimpanzé ---------------------- 100%      
Gorille ---------------------- -------------------------- 100%    
Macaque ---------------------- ------------------------- ------------------------- 100%  
Tarsier ---------------------- ------------------------- ------------------------- ------------------------- 100%

2. Indiquer dans ce tableau le pourcentage d'identité entre les séquences de l'opsine bleue des espèces deux à deux.

3.Ensuite construire l'arbre de parenté en respectant la règle suivante:

Plus le pourcentage d'identité entre les séquences de deux espèces est grand plus les deux espèces sont proches.

Commencer par les deux espèces dont les séquences des opsines sont les plus similaires puis rechercher l'espèce la plus proche des deux premières et ainsi de suite....