• Pour ouvrir une molécule, passer par Fichier, Charger un fichier de molécule.
  Le chargement d'une nouvelle molécule se fait par défaut dans la même fenêtre. Pour charger une deuxième molécule dans une nouvelle fenêtre, cliquer sur Fichier, Nouveau puis Fichier, Charger un fichier de molécule.
   

• Pour déplacer de manière indépendante les molécules ouvertes dans la même fenêtre, le bouton Univers ne doit pas être enfoncé. Le déplacement affecte seulement la molécule sélectionnée. Pour changer de molécule, cliquer sur le bouton "sélectionner une molécule" puis sur la molécule à déplacer.

• Le cliquer-déplacer avec le clic droit permet de déplacer la molécule dans la fenêtre.
• Le cliquer-déplacer avec le clic gauche permet de zoomer si l'on maintient en même temps la touche "shift" enfoncée.

• Pour colorer une molécule, il faut passer par Atomes/colorer par/ :

• CPK  donne une couleur à chaque type d'atomes (C en gris, O en rouge, N en bleu, ...)

• Shapely donne une couleur à chaque petites molécules constitutives des macromolécules (nucléotides pour l'ADN, acides aminés pour les protéines,..).

• Chain donne une couleur à chaque chaîne d'une grosse molécule formée par l'assemblage de plusieurs macromolécules.

• les autres types de coloration.... ne sont utiles qu'aux spécialistes !

• Pour identifier, un atome ou une molécule, il suffit de cliquer de lui cliquer dessus et de lire le bas de l'écran