Reconnaissance de l'antigène par un anticorps

   Utiliser le logiciel Libmol pour localiser la zone de fixation de l'antigène par l'anticorps :

 

- Ouvrir "Libmol" dans un nouvel onglet du navigateur. ici la fiche technique.

- Rechercher dans la librairie de molécule  : anticorps anti-virus de la grippe. Ce fichier présente : l'extrémité d'une chaîne légère et d'une chaîne lourde d'un anticorps (extrémité de l'un des bras court du Y) et  la molécule d'antigène (fixée à l'anticorps).

 

- Afficher la molécule en "sphère" et "chaîne".

On peut identifier le nom de la molécule en plaçant le curseur sur la molécule

Repérer l'extrémité de l'anticorps et l'antigène

 

- Faire tourner la molécule pour montrer la complémentarité de forme entre l'anticorps et l'antigène

Faire une capture d'image et l'intégrer dans le compte rendu

 

- Observer les acides aminés du fragment de l’anticorps qui interagissent avec l’antigène de la grippe

 A l'aide de l'onglet "séquence", afficher les fragments  des deux chaînes de l'anticorps en boules et bâtonnets" .

Dans le menu « interaction », sélectionner la chaîne C puis cliquer sur « créer une nouvelle représentation »

Zoomer sur la molécule et repérer les liaisons entre l'anticorps et l'antigène.

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