Reconnaissance de l'antigène par un anticorps

 

   Utiliser le logiciel Libmol pour localiser la zone de fixation de l'antigène par l'anticorps :

 

- Ouvrir "Libmol" dans un nouvel onglet du navigateur.

- choisir dans la librairie de molécule  : anticorps anti-virus de la grippe. Ce fichier présente : l'extrémité d'une chaîne légère et d'une chaîne lourde d'un anticorps (extrémité de l'un des bras court du Y) et  la molécule d'antigène (fixée à l'anticorps).

 

- Afficher la molécule en "sphère" et "chaîne".

On peut identifier le nom de la molécule en plaçant le curseur sur la molécule

 

- Réalisez une coupe de la molécule pour montrer les caractéristiques de la zone de contact entre les chaînes de l’anticorps et la molécule d'antigène.1

Ouvrir le menu réglage en haut à droite puis  régler la position du plan de coupe avant et ajuster la position de la molécule.

- Observer les acides aminés du fragment de l’anticorps qui interagissent avec l’antigène de  la grippe

 Dans menu réglage (bouton en haut à droite), réinitialiser la molécule.

Afficher les fragments  deux chaînes de l'AC en bâtonnet .

Dans le menu « interaction », sélectionner la chaîne C puis cliquer sur « créer une nouvelle représentation »

Diminuer la distance au maximum

 

ici la fiche technique.