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La fréquence du phénotype LP (lactase persistante) varie d'une population à l'autre :
Fréquence du phénotype LP dans l'ancien monde (http://acces.ens-lyon.fr/)
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Pour comprendre la variation de répartition du phénotype LP, on a effectué le séquençage des allèles du gène de la lactase sur un échantillon de 10 personnes provenant de 3 régions géographiques distinctes : l’Angleterre, le Portugal et le Soudan. Rq : Le séquençage consiste à déterminer la séquence de nucléotides du gène.
Le gène étant localisé sur le chromosome 2, chaque personne possède donc 2 copies (2 allèles) du gène. Chaque fichier ci-dessous contient les séquences des 2 allèles présents chez chacune des 10 personnes, ainsi que les séquences de référence (allèle LNP et les 3 allèles LP). - Séquences pour l'Angleterre : ici (cliquer droit / enregistrer sous / puis ouvrir le fichier enregistré avec anagène). - Séquences pour le Portugal : ici (cliquer droit / enregistrer sous / puis ouvrir le fichier enregistré avec anagène). - Séquences pour le Soudan (nord est de l'Afrique) : ici (cliquer droit / enregistrer sous / puis ouvrir le fichier enregistré avec anagène). Utiliser le logiciel Anagène, pour identifier, dans chacune des 3 populations le nombre d'allèles LNP, d'allèles LP1, d'allèles LP2 et d'allèles LP3. Utiliser les résultats obtenus pour calculer la fréquence de ces allèles dans les 3 populations (voir l'aide si vous n'y arrivez pas !) Utiliser vos résultats pour comprendre la répartition du phénotype LP de la carte ci-dessus. Rq : l'allèle ancestral est l'allèle LNP, les différents allèles LP se sont formés par mutation à partir de cet allèle ancestral. |
